图像比例尺

使用ImageJ软件测量图像中的长度、面积等信息时,需要先设置图像的比例尺,比例尺用于将图像中的像素单位转换为真实的世界单位。

加载图像

启动ImageJ程序,从
File
菜单选择
Open Samples
,选择
Leaf
打开树叶的示例图像:
image

设置比例尺

将图片适当放大,使用
直线工具
沿着图片中的直尺刻度绘制一条直线,作为标尺参考线。绘制的时候可以按住shift键保证直线水平,直线如下图所示:
image

转到
Analyze
菜单,选择
Set Scale...
,在弹出的窗口中输入以下内容,点击
OK
确认设置:
image

  • Distance in Pixels(像素距离)
    :测量的直线的像素长度,软件自动计算不需要设置。
  • Known distance(已知距离)
    :刚才画出的直线代表的真实世界长度,这里是10 mm。
  • Global(全局)
    :是否应用于整个工作流程,如果有同批次同镜头视野的多张照片可以勾选,这里选择不勾选。
  • Pixel aspect ratio(像素纵横比)
    :图像中单个像素的宽度与高度之间的比率,一般设置为1。
  • Unit of length(长度单位)
    :真实世界的长度单位,这里选择毫米(mm)。

标定后图片大小85.57mmx75.27mm,在
Image
->
Properties...
中可看到像素大小为0.1687764 mm:
image

标注比例尺

可以把比例尺到图片上,方便测量、观察。选择菜单栏的
Analyze
->
Tools
->
Scale Bar
,在弹出的界面中设置比例尺颜色位置、长度、字体大小等参数:
image

设置完成后效果如下,如果不想标注部分破坏原图,保存时要选择TIFF格式:
image

测量长度面积

ImageJ提供了许多测量功能,可以打开菜单的
Analyze
->
Set Measurements…
,在弹出的对话框中查看并勾选希望测量的功能:
image

下面以测量主叶脉长度和叶子面积为例,介绍常用的测量方法。

测量长度

选择直线工具,在主叶脉上画一条直线,然后点击
Analyze
->
Measure
进行测量。测量结果如下,长度为59.646mm:
image

测量面积

测量面积的操作类似,主要差异在测量目标的选中上,大致有两种选中方法:

  • 用多边形工具手动框选测量区域
  • 用魔棒工具抠图选中测量区域(推荐)

选中魔棒工具,在叶子的绿色部分点击一下选中。然后双击魔棒工具,调节阀值直到选中整个叶面:
image

点击
Analyze
->
Measure
,测量结果为 2411.380 mm²。

参考资料

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